Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
LynP25911 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
LynP25911 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LynP25911 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
LynP25911 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LynP25911 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LynP25911 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LynP25911 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LynP25911 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LynP25911 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LynP25911 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
LynP25911 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms