Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gria1P23818 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gria1P23818 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms