Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rpl17-ps6-201ENSMUST00000222192 532 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Cox20-201ENSMUST00000027781 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm44830-201ENSMUST00000207667 584 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm44548-201ENSMUST00000208929 192 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Olfr479-201ENSMUST00000063151 1111 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm9972-201ENSMUST00000069051 1533 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps76-201ENSMUST00000173876 739 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Gm43489-201ENSMUST00000196810 993 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd11P23813 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Mir706-201ENSMUST00000102262 84 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm42912-201ENSMUST00000197195 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Skint8-205ENSMUST00000165046 1280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm42438-201ENSMUST00000197832 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Eloc-201ENSMUST00000115352 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Pbdc1-202ENSMUST00000119477 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm12372-201ENSMUST00000121654 768 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 2610001J05Rik-202ENSMUST00000155856 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 4833403J16Rik-201ENSMUST00000204490 1031 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm42556-201ENSMUST00000201397 607 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 1700125G22Rik-201ENSMUST00000181124 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm28975-201ENSMUST00000186412 686 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm25295-201ENSMUST00000122794 306 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Prl5a1-201ENSMUST00000017208 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Scoc-209ENSMUST00000212905 798 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd11P23813 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms