Protein–RNA interactions for Protein: P21619

Lmnb2, Lamin-B2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb2P21619 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmnb2P21619 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmnb2P21619 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms