Protein–RNA interactions for Protein: P21275

Bmp4, Bone morphogenetic protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bmp4P21275 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bmp4P21275 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Bmp4P21275 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms