Protein–RNA interactions for Protein: P20782

Chrne, Acetylcholine receptor subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChrneP20782 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ChrneP20782 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ChrneP20782 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms