Protein–RNA interactions for Protein: P19785

Esr1, Estrogen receptor, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Esr1P19785 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Esr1P19785 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Esr1P19785 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Esr1P19785 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms