Protein–RNA interactions for Protein: P19246

Nefh, Neurofilament heavy polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 1,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefhP19246 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
NefhP19246 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefhP19246 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefhP19246 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefhP19246 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
NefhP19246 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
NefhP19246 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
NefhP19246 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NefhP19246 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NefhP19246 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
NefhP19246 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NefhP19246 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NefhP19246 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NefhP19246 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms