Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tnnc1P19123 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Tnnc1P19123 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms