Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rps6ka3P18654 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Rps6ka3P18654 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rps6ka3P18654 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms