Protein–RNA interactions for Protein: P18531

Ighv3-6, Ig heavy chain V region 3-6, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv3-6P18531 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ighv3-6P18531 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ighv3-6P18531 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.6 ms