Protein–RNA interactions for Protein: P16390

Kcna3, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 3, mousemouse

Predictions only

Length 528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcna3P16390 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Kcna3P16390 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Kcna3P16390 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Kcna3P16390 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms