Protein–RNA interactions for Protein: P14733

Lmnb1, Lamin-B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmnb1P14733 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lmnb1P14733 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lmnb1P14733 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lmnb1P14733 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms