Protein–RNA interactions for Protein: P14206

Rpsa, 40S ribosomal protein SA, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpsaP14206 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
RpsaP14206 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RpsaP14206 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms