Protein–RNA interactions for Protein: P13379

Cd5, T-cell surface glycoprotein CD5, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd5P13379 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cd5P13379 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cd5P13379 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Cd5P13379 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Cd5P13379 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms