Protein–RNA interactions for Protein: P12658

Calb1, Calbindin, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calb1P12658 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb1P12658 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Calb1P12658 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Calb1P12658 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms