Protein–RNA interactions for Protein: P12025

Mdk, Midkine, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MdkP12025 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
MdkP12025 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
MdkP12025 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MdkP12025 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MdkP12025 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MdkP12025 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MdkP12025 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MdkP12025 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MdkP12025 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MdkP12025 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MdkP12025 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MdkP12025 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MdkP12025 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MdkP12025 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MdkP12025 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MdkP12025 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MdkP12025 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MdkP12025 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MdkP12025 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MdkP12025 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms