Protein–RNA interactions for Protein: P11440

Cdk1, Cyclin-dependent kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk1P11440 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdk1P11440 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Cdk1P11440 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms