Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Fv4P11370 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fv4P11370 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms