Protein–RNA interactions for Protein: P11260

Lire1, LINE-1 retrotransposable element ORF1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lire1P11260 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lire1P11260 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Lire1P11260 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Lire1P11260 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms