Protein–RNA interactions for Protein: P10629

Hoxc6, Homeobox protein Hox-C6, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc6P10629 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hoxc6P10629 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hoxc6P10629 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hoxc6P10629 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms