Protein–RNA interactions for Protein: P10085

Myod1, Myoblast determination protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myod1P10085 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Myod1P10085 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Myod1P10085 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms