Protein–RNA interactions for Protein: P0DMN7

Amd1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Amd1P0DMN7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Amd1P0DMN7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Amd1P0DMN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms