Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Igsf6P0C6B7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Igsf6P0C6B7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Igsf6P0C6B7 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms