Protein–RNA interactions for Protein: P0C1Z5

Putative UPF0730 protein encoded by LINC00643 homolog, mousemouse

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Length 52 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0C1Z5 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
P0C1Z5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
P0C1Z5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms