Protein–RNA interactions for Protein: P09920

Csf3, Granulocyte colony-stimulating factor, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3P09920 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Csf3P09920 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Csf3P09920 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms