Protein–RNA interactions for Protein: P07978

Prm2, Protamine-2, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prm2P07978 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC9.07□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Prm2P07978 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms