Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Me1P06801 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Me1P06801 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Me1P06801 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Me1P06801 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Me1P06801 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Me1P06801 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Me1P06801 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Me1P06801 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Me1P06801 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Me1P06801 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Me1P06801 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms