Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2-Eb1P04230 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
H2-Eb1P04230 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2-Eb1P04230 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms