Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
H2-Ab1P01921 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2-Ab1P01921 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms