Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
H2-AaP01910 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
H2-AaP01910 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms