Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
H2-K1P01901 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
H2-K1P01901 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms