Protein–RNA interactions for Protein: P01897

H2-L, H-2 class I histocompatibility antigen, L-D alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-LP01897 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
H2-LP01897 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
H2-LP01897 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1247.9 ms