Protein–RNA interactions for Protein: P01788

Ig heavy chain V region H8, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01788 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
P01788 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01788 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01788 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
P01788 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
P01788 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
P01788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
P01788 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P01788 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P01788 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P01788 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P01788 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
P01788 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P01788 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P01788 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P01788 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms