Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Apaf1O88879 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apaf1O88879 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apaf1O88879 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms