Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tom1O88746 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tom1O88746 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Tom1O88746 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tom1O88746 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tom1O88746 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tom1O88746 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms