Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nid2O88322 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Nid2O88322 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nid2O88322 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nid2O88322 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nid2O88322 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nid2O88322 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nid2O88322 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nid2O88322 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms