Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cfdp1O88271 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cfdp1O88271 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms