Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Xirp1O70373 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Xirp1O70373 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms