Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Itgb5O70309 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Itgb5O70309 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Itgb5O70309 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Itgb5O70309 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Itgb5O70309 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms