Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lnx1O70263 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx1O70263 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx1O70263 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms