Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nipsnap2O55126 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Nipsnap2O55126 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms