Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Dsg2O55111 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Dsg2O55111 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms