Protein–RNA interactions for Protein: O54957

Lat, Linker for activation of T-cells family member 1, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LatO54957 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LatO54957 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LatO54957 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LatO54957 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LatO54957 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
LatO54957 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
LatO54957 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
LatO54957 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
LatO54957 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
LatO54957 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LatO54957 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LatO54957 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LatO54957 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LatO54957 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
LatO54957 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
LatO54957 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
LatO54957 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms