Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
NlkO54949 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
NlkO54949 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
NlkO54949 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
NlkO54949 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
NlkO54949 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
NlkO54949 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
NlkO54949 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms