Protein–RNA interactions for Protein: O54941

Smarce1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarce1O54941 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Smarce1O54941 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Smarce1O54941 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Smarce1O54941 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms