Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itgb3O54890 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Itgb3O54890 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms