Protein–RNA interactions for Protein: O54827

Atp10a, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, mousemouse

Predictions only

Length 1,508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp10aO54827 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
Atp10aO54827 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Atp10aO54827 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms