Protein–RNA interactions for Protein: O54692

Zw10, Centromere/kinetochore protein zw10 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zw10O54692 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Zw10O54692 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Zw10O54692 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Zw10O54692 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms