Protein–RNA interactions for Protein: O35516

Notch2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 2,470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Notch2O35516 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Notch2O35516 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Notch2O35516 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Notch2O35516 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Notch2O35516 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Notch2O35516 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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